随着近年泥鳅养殖技术的成熟，放养密度日趋增大，泥鳅病害时有发生，且一旦发生病害，死亡率较高。通常病害防治要本着“重在防治，有病早治”的原则，平时加强水质管理及投喂管理。下面简单介绍一下泥鳅常见疾病的防治。
    1.水霉病
    水霉病又称肤霉病或白毛病，是水产动物真菌病之一，也是常见疾病之一，此类菌对温度适应范围广，5℃~26℃均可生产繁殖，最适温度13℃~18℃，水质较清的水体易生长繁殖。造成此种病的因素大约有：一是受伤或局部组织坏死；二是水温剧烈变化（抵抗力下降，组织变坏）；三是季节交替时易发生。
泥鳅目前多为自然苗，苗种下塘前多易受伤，加之此时水温正适合霉菌的生产，因而水霉病为泥鳅苗种期间常见病之一。
    防治方法：
    （1）彻底清塘，从而杜绝病菌来源，从而可有效防治该病的发生。
    （2）放苗前对池水严格消毒。
    （3）捕捞时操作要细心，防止鱼苗受伤。
    一旦发生该病，应在早期进行治疗为好。对得病的苗种可用2%~3%的食盐水洗5~10分钟。每亩使用5kg菖蒲、0.5~1kg食盐，对15~20kg人尿，全池泼洒。
    2 .红鳍病
    又名赤鳍病、腐鳍病，大多由一种杆菌引起。泥鳅被感染后，鳍、腹部及肛门周围有充血发白并溃烂症状，有时则有出血斑点、肌肉腐烂，尾鳍、胸鳍发白并溃烂等现象。
    治疗方法：
    治疗可用“二氧化氯”或“强氯精”泼洒，严重时连续使用2次，同时按饲料重0.3%中“氟苯尼考粉”进行投喂5~7天。
    3.肠炎病
    亦叫烂肠瘟、乌头瘟。患病症状：行动缓慢，停止摄食，鳅体发乌变青，头部显得特别，腹部出现红斑，肠管充血和黄色黏液流出，重者发紫，很快死亡。
治疗方法：（1）每50千克泥鳅用“新鱼血停”5克，饲料中按饲料重0.5%添加“鱼用多维”拌料投喂，连喂3天即可，（2）每50千克泥鳅用8克大蒜素拌料投喂5~7天。